IBM和喬治亞理工學院日前宣布,世界上最強大的超級計算集群之一將落戶喬治亞理工學院新建成的系統(tǒng)生物學研究中心。
該中心將使用IBM技術來推動新藥物的研究,治療當今一些對人類生命威脅最大的疾病,包括癌癥。中心的研究工作將由世界領先的系統(tǒng)生物學家之一Jeffrey Skolnick博士領導,他曾在計算系統(tǒng)生物學領域獲得喬治亞研究聯(lián)盟杰出學者獎。
由美國喬治亞州、喬治亞研究聯(lián)盟和美國國家健康協(xié)會出資850萬美元成立的這一新系統(tǒng)生物學研究中心,將Skolnick博士的生物醫(yī)學研究的專業(yè)知識與IBM的高性能計算功能融合在一起,開發(fā)出一臺全新的超級計算機。這個運行Linux的全新超級計算集群將是全球運行速度最快的超級計算集群之一,也是美國東南部研究型大學最強大的計算集群之一。該集群將由BellSouth公司設在亞特蘭大市中心的世界級設施來托管運行。
Skolnick博士表示:“通過在研究工作中使用IBM技術,我們可以顯著縮短新藥物進入市場的時間。系統(tǒng)生物學將數(shù)學、物理、化學和生物學與先進的高性能計算和工程設計融合在一起。生物信息學和系統(tǒng)生物學使我們能夠充分利用人體基因序列提供的大量信息,使得藥物開發(fā)人員能夠將他們必須進行篩選的化合物數(shù)量減少十倍?!?/p>
由1000個節(jié)點組成的Cluster 1350系統(tǒng)基于IBM BladeCenter刀片系統(tǒng),采用雙內(nèi)核AMD Opteron處理器,每秒鐘可完成超過8.5萬億次計算。如果按照2005年11月的TOP500排名,這樣的性能在世界最強大的超級計算機中可以排到第41位。系統(tǒng)性能和可擴展性將使學校的學生和教員能夠快速準確的分析復雜的DNA和蛋白質,以確定有關人體癌癥基因和蛋白質的生物學和化學過程,從而為治療這類疾病研發(fā)出更具針對性的藥物。
IBM BladeCenter刀片服務器副總裁Doug Balog表示:“現(xiàn)今的大學正在尋求最快、最具創(chuàng)新性和性價比最高的系統(tǒng)來幫助自己的知識群體,使其能夠將具有可行性的研究成果轉化到商業(yè)市場。使用基于AMD Opteron LS20 IBM BladeCenter刀片服務器的Cluster 1350系統(tǒng),喬治亞理工學院的學生和教師可以獲得足夠的處理能力和系統(tǒng)資源來幫助他們在研究中做出更準確的決策,并提升學院在全國最出色研究機構中的形象。”
喬治亞研究聯(lián)盟主席兼首席執(zhí)行官Mike Cassidy表示:“只有最了解技術的大學才能夠參與藥物發(fā)現(xiàn)和生物信息學領域的競爭。喬治亞理工學院對頂級技術和研究設施的重視以及Jeff Skolnick博士和其它世界級學者們的魅力,將會提升學院在競爭性市場中的表現(xiàn),并吸引美國最聰明的學生加入到我們的研究團隊中,共同推動藥物開發(fā),從而改善人們的生活?!?/p>
通過與喬治亞理工學院和IBM的緊密合作,BellSouth為支持這一高能耗密度的超級計算集群設計了獨一無二的可靠的主機托管環(huán)境。
BellSouth公司首席技術官Bill Smith表示:“基于我們在主機托管領域的背景,我們擁有足夠的靈活性和經(jīng)驗快速創(chuàng)建一個支持喬治亞理工大學和IBM的解決方案,從而為Skolnick博士創(chuàng)造性的研究工作提供支持。”
新超級計算機的峰值性能超過每秒鐘16萬億次浮點運算(16 TeraFlops),由一個包括1000個采用AMD Opteron處理器的LS20刀片服務器節(jié)點的集群組成。基礎架構節(jié)點運行Red Hat Linux 4操作系統(tǒng),計算節(jié)點上運行Scientific Linux操作系統(tǒng)。這樣的超級計算機結構組成了可以預先安裝和測試、擁有超高密度并易于管理的超級集群IBM Cluster 1350。
AMD全球商業(yè)業(yè)務部副總裁Kevin Knox表示:“AMD64技術提供了對運行有最高要求的超級計算機所需的處理能力,而且不會犧牲每瓦特電力的性能效率。通過與IBM在基于AMD Opteron處理器的BladeCenter刀片服務器集群上的緊密合作,我們相信喬治亞理工學院的研究人員將獲得更好的設備,在苛刻的時間限制下完成工作,以更快的速度為市場提供重要的藥物和研究成果?!?/p>
